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Infrastructures et équipements partagés

Le réseau FRAP s’appuie sur un ensemble d’infrastructures et de plateformes technologiques d’excellence réparties sur tout le territoire français. Ces ressources, ouvertes et mutualisées, constituent un socle essentiel pour soutenir la recherche fondamentale, translationnelle et clinique sur le cancer du pancréas.

Plateformes animales

PSEA – Plateforme pour l’Hébergement et l’Expérimentation Animale, Marseille

Le PSEA est une installation de pointe pour les souris offrant des services pour l’élevage d’animaux de type sauvage et génétiquement modifiés dans des zones protégées EOPS, exemptes de pathogènes spécifiques. Les animaux sont hébergés dans des cages ventilées en conditions stériles, avec du personnel expert pour assister dans le génotypage et les injections de cellules ES.
Caractéristiques clés :

  • 250 m² divisés en 4 zones A1+ (700–1200 cages) et 1 zone A2 (244 cages)
  • Laboratoire expérimental (30 m²) avec imagerie bioluminescente et fluorescence intra-vivante (BioSpaceLab Photon Imager)
  • Stockage d’équipements autoclavés et zones de circulation
  • Géré par des conseillers techniques et scientifiques, sous la supervision d’un responsable pharmacie et d’un comité “bien-être”
  • Partie d’un réseau d’installations partagé par les instituts de recherche Cancer & Immunology et Institut de Biologie de Développement de Marseille

Plateforme d’Imagerie P-PAC, CRCL Lyon

Située au Centre Léon Bérard, la plateforme P-PAC soutient la recherche académique et industrielle sur les souris et les rats, offrant des outils essentiels d’imagerie in vivo.
Capacités :

  • Scanner à rayons X
  • Imagerie par fluorescence
  • Utilisation de maisons animales SPF et laboratoires expérimentaux pour les études précliniques
  • Soutenue par le programme d’investissement PhenoCan ; maintenue par SFR Santé Lyon EST

Plateforme Animale EOPS 1, Lille

Cette installation assure la conformité avec la législation française et la Directive Européenne 2010/63/EU, accueillant des projets de recherche sur le cancer, y compris des xénogreffes dérivées de patients.
Services :

  • Hébergement de rongeurs avec statut sanitaire SPF/SOPF
  • Niveaux de confinement A1–A3
  • Élevage de lignées de souris
  • Phénotypage, études fonctionnelles et comportementales
  • Imagerie in vivo en collaboration avec les plateformes BICeL et LiiFE
  • Soutenue par un vétérinaire et une Structure de Bien-être Animal (SBEA)

Plateforme CREFRE-Oncopole, Toulouse

Un service du CRCT, Toulouse, centré sur l’exploration fonctionnelle et la caractérisation phénotypique des modèles animaux.
Points forts :

  • Études fonctionnelles, cryoconservation et recherches méthodologiques
  • Promotion des principes des 3R (Réduire, Raffiner, Remplacer)
  • Intégration de l’ingénierie génétique, de l’imagerie multimodale et de l’élevage animal
  • Collaboration avec des partenaires académiques et biotechnologiques pour le transfert de technologie

Plateforme FRIM, CRI Paris

Dédiée à l’imagerie clinique et préclinique de petits animaux, FRIM combine des modalités d’imagerie avancées avec un support expert pour la recherche en oncologie.
Capacités :

  • IRM (7T), PET/IRM, SPECT/CT, échographie
  • Laboratoire de radiomarquage pour Gallium-68, Fluorine-18, Cuivre-64
  • Expertise en PET/IRM/MRE et techniques innovantes de radiomarquage
  • Soutien aux projets de recherche préclinique et clinique
  • Partie des réseaux nationaux IBiSA et France Life Imaging (FLI)

Plateformes d’organoïdes

Plateforme OrgaRES, Lille

Dirigée par le Dr Audrey Vincent, OrgaRES développe des organoïdes tumoraux 3D à partir d’échantillons de patients pour un criblage rapide des chimiothérapies et thérapies ciblées.
Points forts :

  • Taux de réussite élevé pour les cancers du tractus digestif (70–90%)
  • Modélisation de la chimiorésistance et de l’hétérogénéité tumorale
  • Collaboration avec des installations de cytométrie et de tri cellulaire
  • Certifié IBiSA et engagé dans des consortiums nationaux et internationaux

Plateforme 3D Hub-O Organoid, Marseille

Soutient le développement d’organoïdes issus de multiples types de cancer, y compris l’adénocarcinome canalaire pancréatique (PDAC).
Équipements :

  • Stéréomicroscope Leica M205FA
  • Microscope motorisé Evos M7000
  • Électroporateur Sonidel NEPA21
  • Infrastructure complète pour la culture cellulaire

Plateformes de génomique

Plateforme Go@L-GFS, Lille

Fournit des outils génomiques pour la recherche sur le cancer à grande échelle, incluant séquençage, analyse unicellulaire et épigénomique.
Équipements clés :

  • NovaSeq 6000, Oxford Nanopore, Chromium, Nanostring nCounter
  • Support en bioinformatique et biostatistique
  • Gestion d’environ 1000 échantillons/an sur 30 projets

Plateforme NGS, Institut Curie, Paris

Propose séquençage haut débit et support bioinformatique pour la recherche fondamentale et translationnelle.
Caractéristiques :

  • Séquençage Illumina et PacBio
  • Certifié ISO9001 et NFX50-900
  • Support pour le génome, l’exome, l’ARN, ChIP-seq et protocoles personnalisés

Plateforme CRISPR’IT, Paris

Soutient les criblages CRISPR à l’échelle du génome, de la préparation de bibliothèques à l’analyse bioinformatique, pour les études de génomique fonctionnelle.

Plateforme Single Cell Omics, Paris

Fournit des technologies unicellulaires personnalisées incluant smartseq3, Indrop, 10X Chromium et chip-seq pour les analyses transcriptomiques.

Plateforme CHICS, Paris

Spécialisée en immunohistochimie multiplex, biologie spatiale et imagerie cellulaire avec analyse basée sur l’IA.
Instruments :

  • Plateformes de spatial-omics (GeoMx, VISIUM, Phenocycler)

Plateformes de cytométrie en flux

IMRB, Paris

Équipé de trieurs et analyseurs cellulaires avancés (BD Influx, Aria Fusion, LSR Fortessa X20, MACSQuant 16).
Services :

  • Caractérisation et tri cellulaire
  • Conception de panels haute-capacité et analyse de données
  • Collaboration avec la plateforme d’immuno-surveillance PI3

CRCL, Lyon

Offre une cytométrie complète et un accompagnement expert pour la recherche académique et industrielle.

Plateforme CHICS, Paris

Spécialisée en immunohistochimie multiplex, biologie spatiale et imagerie cellulaire avec analyse basée sur l’IA.
Instruments :

  • Cytomètres en flux

Plateformes de protéomique et d’imagerie tissulaire

MALDI iMAP, CRI Paris

Réalise une imagerie moléculaire haute résolution par spectrométrie de masse MALDI pour cartographier protéines, lipides et médicaments au niveau cellulaire.

Plateforme CRCM Proteomics, Marseille

Fournit support en protéomique, spectrométrie de masse et bioinformatique pour la découverte de biomarqueurs et la recherche fondamentale.
Équipements :

  • Spectromètres de masse Orbitrap, MALDI-TOF-TOF
  • Systèmes de nanochromatographie
  • Support à la protéomique quantitative et ciblée

Plateforme CHICS, Paris

Spécialisée en immunohistochimie multiplex, biologie spatiale et imagerie cellulaire avec analyse basée sur l’IA.
Instruments :

  • Imagerie confocale et multispectrale
  • Systèmes histologiques automatisés
  • Plateformes de spatial-omics (GeoMx, VISIUM, Phenocycler)

Vésicules extracellulaires & Virologie

CRI Extracellular Vesicles Core Facility, Paris

Expertise dans la production, l’isolement et la caractérisation des vésicules extracellulaires.

Plateforme Virologie, CRCT Toulouse

Propose production de virus oncolytiques BSL-3, services personnalisés de lentivecteurs et AAV, ainsi que formation aux techniques de vecteurs viraux et à l’édition CRISPR du génome.

Plateformes IF multiplex

CRCL, Lyon

Située au sein des installations CRCL, cette plateforme fournit des services d’imagerie par immunofluorescence (IF) multiplex pour la recherche préclinique et translationnelle. Elle permet l’imagerie tissulaire et cellulaire haute-capacité pour les études en cancer et immunologie.

CRC CHICS, Paris

La plateforme CHIC propose l’IF multiplex dans le cadre de ses services en biologie spatiale et imagerie tissulaire. Elle soutient la recherche académique et industrielle, offrant accès aux instruments, expérimentation complète et analyse de données pour le phénotypage tissulaire complexe.

Lille

Cette plateforme est intégrée à l’infrastructure de recherche locale et offrira des capacités d’IF multiplex pour soutenir des projets en cancer, immunologie et translation. Les détails sur les instruments et services seront communiqués ultérieurement.

IPC, Marseille

La plateforme IF multiplex de l’Institut Paoli-Calmettes (IPC) soutient l’imagerie haute résolution d’échantillons tissulaires. Elle se concentre sur la recherche en cancer, offrant à la fois l’accès aux instruments et le support technique pour des analyses multiplex complexes.

CRCT, Toulouse

Intégrée aux installations du CRCT, cette plateforme fournit l’imagerie IF multiplex pour les études précliniques. Elle permet une analyse spatiale détaillée des échantillons tissulaires afin de soutenir les programmes de recherche en oncologie et translationnelle.